Региональная геология, геологическое картографирование и методическое обеспечение

Центр государственного геологического картографирования
  Отдел региональных геологоразведочных работ
  Отдел сводного и обзорного геологического картографирования
      Сектор сводного геологического картографирования
  Сектор по обеспечению деятельности Главной редколлегии

Центр дистанционных методов природоресурсных исследований ВСЕГЕИ (ЦДМИ ВСЕГЕИ)
  Сектор подготовки информации данных дистанционного зондирования (ДДЗ)
  Сектор научно-методических и технологических разработок

Отдел четвертичной геологии и геоморфологии

Отдел региональной геологии и полезных ископаемых Западных районов
  Лаборатория четвертичной микропалеонтологии
  Сектор геологии докембрия

Отдел региональной геологии и полезных ископаемых Урала и Западной Сибири

Отдел региональной геологии и полезных ископаемых Восточной Сибири

Отдел региональной геологии и полезных ископаемых Восточных районов России
  Сектор Дальнего Востока
  Сектор Северо-Востока
  Сектор региональных прогнозно-минерагенических исследований

Центр научно-методического и организационного обеспечения государственного геологического картографирования
  Отдел методики государственного геологического картографирования и геологосъемочных работ
  Отдел стратиграфии и палеонтологии
      Палеонтологическая лаборатория
  Отдел петрологии
  Отдел прогнозной и геолого-экономической оценки месторождений полезных ископаемых
  Сектор по обеспечению деятельности Научно-редакционного совета по геологическому картированию территории Российской Федерации Федерального агентства по недропользованию (НРС Роснедра)
  Отдел организации обеспечения полевых работ