ФГБУ «ВСЕГЕИ» проводит региональное геологическое изучение недр, включающее геологическое картографирование, региональные геолого-геофизические работы, а также связанные с ними научно-исследовательские работы. Наиболее крупным системным направлением регионального геологического изучения недр является государственное геологическое картографирование, которое формирует банк фундаментальной информации о геологическом строении и минерагеническом потенциале территории Российской Федерации и обеспечивает разработку и реализацию рационального использования недр. В рамках государственного геологического картографирования создаются карты масштаба 1 : 2 500 000 – 1 : 5 000 000 (сводное и обзорное картографирование), масштаба 1 : 1 000 000 третьего поколения (ГГК-1000/3) и 1 : 200 000 второго поколения (ГГК-200/2). Карты создаются в аналоговой и цифровой формах с электронными базами данных.
Обеспечение государственного геологического картографирования возложено на отделы по региональной геологии, отдел четвертичной геологии, Центр дистанционных методов природоресурсных исследований и Центр научно-методического и организационного обеспечения государственного геологического картографирования под руководством Центра государственного геологического картографирования.
Центр государственного геологического картографирования
Отдел региональных геологоразведочных работ
Отдел сводного и обзорного геологического картографирования
Сектор сводного геологического картографирования
Сектор по обеспечению деятельности Главной редколлегии
Центр дистанционных методов природоресурсных исследований ВСЕГЕИ (ЦДМИ ВСЕГЕИ)
Сектор подготовки информации данных дистанционного зондирования (ДДЗ)
Сектор научно-методических и технологических разработок
Отдел четвертичной геологии и геоморфологии
Отдел региональной геологии и полезных ископаемых Западных районов
Лаборатория четвертичной микропалеонтологии
Сектор геологии докембрия
Отдел региональной геологии и полезных ископаемых Урала и Западной Сибири
Отдел региональной геологии и полезных ископаемых Восточной Сибири
Отдел региональной геологии и полезных ископаемых Восточных районов России
Сектор Дальнего Востока
Сектор Северо-Востока
Сектор региональных прогнозно-минерагенических исследований
Отдел региональной геологии и полезных ископаемых полярных и приполярных территорий
Центр научно-методического и организационного обеспечения государственного геологического картографирования
Отдел методики государственного геологического картографирования и геологосъемочных работ
Отдел стратиграфии и палеонтологии
Палеонтологическая лаборатория
Отдел петрологии
Отдел прогнозной и геолого-экономической оценки месторождений полезных ископаемых
Сектор по обеспечению деятельности Научно-редакционного совета по геологическому картированию территории Российской Федерации Федерального агентства по недропользованию (НРС Роснедра)
Отдел организации обеспечения полевых работ
Сектор организации геолого-экскурсионной деятельности
